Tahun 2013, Kepala MAN 1 Kota Bandung Drs. H. Awaludin Hamzah, M.Ag. melakukan penyesuaian program dengan perubahan kurikulum 2013, salah satu gagasan yang mendasar adalah bahwa Pesantren Al-Murabbybersifat Terbuka bagi peserta didik       yang ingin memperdalam ilmu-ilmu keagamaan (Islam) tanpa membedakan jurusan/program, sehingga arah kebijakannya adalah menciptakan generasi yang mutafaqqih fie al-diin (yang mendalam ilmu agama).
Tahun 2016 Kepala MAN 1 Kota Bandung Drs. Misbakhudin, M.M.Pd. menjadikan Pesantren Al-Murabby sebagai bagian tidak     terpisahkan dengan program madrasah. Hal ini dilakukan dengan memasukkan program pesantren terhadap program umum  madrasah walaupun pengelolaan dilaksanakan secara mandiri